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Caracterización con RAMs de la colección de durazno (Prunus persica L. Batsch) existente en la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia Acta Agron. (Palmira)
Morillo Coronado,Ana Cruz; Morillo Coronado,Yacenia; Pinzón Sandoval,Elberth Hernando.
Utilizando ocho cebadores Microsatélites Amplificados al Azar (RAMs) fue evaluada la diversidad genética de 31 materiales de Prunus de la colección de caducifolios existente en la Universidad Pedagógica y Tecnológica de Colombia. Se generaron un total de 121 amplicones con pesos moleculares entre 260 y 1000 Kb. Con un coeficiente de similitud de 0.75, se formaron tres grupos, de acuerdo principalmente con las características del fruto, encontrando en el grupo 2 las variedades de importancia económica. El número de loci polimórficos varió entre 5 y 16 para los cebadores GT y CCA, respectivamente. El valor promedio de heterocigosidad fue de 0.22, más bajo que los encontrados en otros estudios de diversidad genética en el género Prunus; por tanto, se deben...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores genéticos; Prunus; Diversidad genética; Microsatélites RAMs; Caducifolios; Genetic markers; Prunus; Genetic diversity; Microsatellites RAMs; Deciduous fruit trees.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122014000400009
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Diversidad genética de cepas de Escherichia coli O145:NM/H27 aisladas en la provincia de Buenos Aires ABCL
Zotta,Claudio Marcelo; Chinen,Isabel; Lavayén,Silvina; Carbonari,Carolina; Monzani,Victoria; Morvay,Laura; Rivas,Marta.
Escherichia coli productora de toxina Shiga (STEC), fundamentalmente del serotipo O157:H7, está asociada a la ocurrencia de casos esporádicos y brotes de diarrea sanguinolenta (DS) y síndrome urémico hemolítico (SUH). Otros serotipos STEC como O26:H11, O103:H2, O111:NM, O113:H21 y O145:NM también pueden causar enfermedad severa. En Argentina O157:H7 es el serotipo prevalente siguiéndole en frecuencia O145:NM. El objetivo del presente trabajo fue establecer la diversidad genética y la relación clonal de cepas de E. coli O145:NM/H27 aisladas en diferentes localidades de la provincia de Buenos Aires en el período 2004-2009. A 17 cepas aisladas de casos de SUH (9), DS (5) y de contactos asintomáticos (3) se les realizó PCR para detectar genes stx1, stx2,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversidad genética; Relación clonal; Escherichia coli O145:NM/H27; Electroforesis en gel en campos pulsados.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572014000100011
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RELACIONES FILOGEOGRÁFICAS DE ALGUNAS COLONIAS DE ALIMENTACIÓN Y ANIDACIÓN DE LA TORTUGA CAREY (ERETMOCHELYS IMBRICATA) EN EL PACÍFICO Y CARIBE COLOMBIANOS* Boletín de Investigaciones
Trujillo-Arias,Natalia; Amorocho,Diego F; López-Álvarez,Diana; Mejía-Ladino,Luz M.
La tortuga marina Eretmochelys imbricata habita en aguas tropicales de todos los océanos. La especie está considerada en peligro crítico de extinción por la IUCN y sus poblaciones se encuentran afectadas por el tráfico internacional de los escudos de su caparazón. La presente investigación es pionera en Colombia y en el océano Pacífico oriental tropical, ya que por medio de la amplificación de secuencias de la región control del ADNmt se caracterizaron genéticamente las poblaciones de la especie localizadas en: 1) Parque Nacional Natural Gorgona, 2) Corales del Rosario y San Bernardo y 3) Cabo de la Vela (La Guajira). Se encontraron dos haplotipos nuevos para el Pacífico oriental, aunque los índices de diversidad fueron bajos (h: 0.2857 ± 0.1964; π: 0.0009...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Tortugas marinas; Eretmochelys imbricata; Región control ADN mitocondrial; Diversidad genética; Análisis filogenético.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0122-97612014000100008
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Diversidad genética de aislados de Ralstonia solanacearum de Cuba, mediante amplificación de las regiones repetitivas del genoma (REP-PCR) Rev. Protección Veg.
Naranjo Feliciano,Eber; Yglesia Lozano,Aleika; García,Armando; Martínez Zubiaur,Yamila.
Se estableció la diversidad genética de 30 aislados cubanos de Ralstonia. solanacearum, obtenidos de papa y tomate y pertenecientes a los biovares 1 y 2, mediante la amplificación de las secuencias consenso repetitivas intergénicas de enterobacterias (rep-PCR) con los cebadores ERIC. El método permitió distinguir 11 genotipos entre los aislados cubanos. Las agrupaciones primarias alcanzadas, mediante el análisis de conglomerados, se correspondieron con el biovar de los aislamientos, mientras que las subdivisiones encontradas dentro de cada grupo, tuvieron relación con el hospedero del cual fueron obtenidos. Los aislados de papa mostraron un coeficiente de similitud del 37,2% y la presencia de variantes específicas para cada región geográfica dentro de cada...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Ralstonia solanacearum; Diversidad genética; Rep-PCR; Papa; Tomate.
Ano: 2015 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522015000100009
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Diversidad genética de aislados de Ralstonia solanacearum procedentes de tres regiones de Colombia Rev. Protección Veg.
Cardozo Burgos,Carolina; Silva Aguilar,Bernardo; Salazar Yepes,Mauricio; Morales Osorio,Juan Gonzalo.
Este trabajo se realizó con el objetivo de analizar la diversidad genética del complejo de especies Ralstonia solanacearum en tres regiones de Colombia donde se siembran cultivos hospedantes de gran importancia económica para el país. Se colectaron 69 aislamientos procedentes de suelo y diferentes hospedantes. Para determinar la diversidad genética entre los aislados se utilizaron los marcadores moleculares del tipo microsatélite amplificados al azar (RAMs). Los datos se analizaron utilizando el coeficiente de Nei-Li, el análisis de correspondencia múltiple (ACM) y el índice de Shannon. Los valores del coeficiente de Nei-Li, a un nivel de similaridad de 0,76%, permitieron agrupar los aislamientos en tres divisiones. El ACM arrojó un valor de similitud del...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Ralstonia solanacearum; Diversidad genética; RAMs.
Ano: 2015 URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522015000300007
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Estudio molecular preliminar de accesiones de maíz (Zea maysL.) criollo e indígena Colombiano, utilizando una región de ADN cloroplástico Acta Agron. (Palmira)
Revelo Portilla,Ediel Armando; Cardozo Conde,Carlos Iván; Caetano,Creucí María.
Se exploró en forma preliminar la diversidad genética existente en las 23 razas de maíz criollo e indígena descritas para Colombia por Roberts y colaboradores (1957), para el efecto se evaluaron 28 cebadores nucleares y cloroplásticos. Catorce de ellos amplificaron en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y fueron enviados para secuenciar a Macrogen Inc. (Corea). Mediante programas bioinformáticos (BioEdit 7.1.0, ClustalW versión 1.81, EditPlus Text Editor versión 3.20 y Gblock 0.91b 8) se encontró que ocho de estos cebadores presentaron un nivel alto de polimorfismo. La región genómica cloroplástica AtpB-1-RbcL-1 mostró el mayor polimorfismo y por tanto se utilizó para evaluar 23 materiales representativos de las 23 razas conservadas en el Banco de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: ADNcp; Diversidad genética; Zea mays L; Razas criollas; Colombia.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122015000100009
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Caracterización molecular de palma de aceite Elaeis guineensis Jacq., procedente de diferentes orígenes (Zaire y Camerún) usando marcadores microsatélites Acta Agron. (Palmira)
González Chavarro,Carlos Felipe; León Lozano,Marlon Eduardo; Morillo Coronado,Ana Cruz; Ochoa,Erick Iván; Morillo Coronado,Yacenia.
Se determinó la variabilidad genética de 96 accesiones de palma de aceite (E. guineensis Jacq.) procedentes de Camerún y Zaire con 20 marcadores microsatélites. 59 alelos fueron detectados con un promedio de 2.95, tres loci fueron polimórficos con un PIC (Índice de Información Polimórfica) promedio de 0.58. Se encontró una alta diversidad genética, con una heterocigocidad total de 0.46, y un alto porcentaje de loci polimórficos del 90%. El valor de F ST encontrado fue de 0.14, lo cual sugiere que en las poblaciones de Camerún y Zaire existe una moderada estructura poblacional. La heterocigocidad observada (Ho=0.67) fue mayor que la heterocigocidad esperada (He=0.42), evidenciando una baja presencia de homocigotos. Los parámetros de diferenciación...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversidad genética; Estructura poblacional; Conservación; Heterocigocidad esperada y observada.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122016000300010
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Estructura genética y caracterización molecular del cerdo criollo (Sus scrofa domestica) de Ecuador, utilizando marcadores microsatélites Acta Agron. (Palmira)
Vargas Burgos,Julio César; Velázquez Rodriguez,Francisco Jesús; Chacón Marcheco,Edilberto.
Los marcadores moleculares han mostrado su gran utilidad en la caracterización de los animales domésticos, por ello, el objetivo de este trabajo fue caracterizar genéticamente al cerdo criollo de Ecuador mediante el uso de microsatélites. Se recolectaron muestras de pelo de 15 animales. Se utilizó un panel de 25 microsatélites, la amplificación de los mismos se realizó mediante la reacción en cadena de la polimerasa y los fragmentos amplificados, separados por electroforesis en geles de poliacrilamida. Se calcularon el número medio de alelos por locus (MNA), las frecuencias alélicas, las heterocigosidades esperada (He) y observada (Ho), el contenido de información polimórfica (PIC), así como el equilibrio Hardy-Weinberg (EHW) y el F IS por marcador. El...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversidad genética; Frecuencias alélicas; Heterocigosidad esperada; Heterocigosidad observada; Contenido de información polimórfica.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122016000300012
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Caracterización morfo-agronómica de poblaciones de zapallo criollo (cucurbita maxima Duch.) colectadas en los valles andinos de la Argentina Agriscientia (Córdoba)
Lorello,I.M; García Lampasona,S.C; Makuch,M.A; Peralta,I.E.
En los valles andinos de la Argentina las familias producen hortalizas en forma tradicional principalmente para el autoconsumo. El zapallo (Cucurbita maxima) es un cultivo americano de gran importancia en las economías regionales andinas. Estas poblaciones criollas de zapallos se están perdiendo por el éxodo rural, la sustitución de semilla criolla por semilla comercial y las sequías frecuentes. Constituyen reservorios de genes de interés para el mejoramiento y para garantizar la seguridad alimentaria local, por lo que su conservación y caracterización son fundamentales para evitar la erosión genética. Durante 2005 se realizaron colectas en Valle Fértil, provincia de San Juan y en el noroeste argentino; se colectaron 61 poblaciones, de las cuales 27 se...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cucurbita maxima; Caracterización morfo-agronómica; Diversidad genética; Recursos genéticos.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1668-298X2016000100005
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Diversidad genética de la región intergénica (TrnL-F) de cloroplasto en poblaciones de Pholisma culiacanum Y. Agrociencia
Linares-Holguín,O. Omer; Sánchez-Peña,Pedro; Molina-Freaner,Francisco.
Resumen Pholisma culiacanum es una holoparásita de raíz, endémica de los estados de Sinaloa y Sonora, México, y tiene importancia cultural, alimenticia, biológica y evolutiva. Esta planta es un modelo agrícola adecuado como fuente alternativa de nutrientes y para entender los cambios moleculares de la fotosíntesis del autotrofismo al parasitismo. El objetivo de este estudio fue analizar la diversidad genética de siete poblaciones de P. culiacanum de Sinaloa y Sonora. En 70 muestras se analizaron secuencias de un fragmento de ADN de cloroplasto (Trnt-TrnF) para calcular la variación genética dentro (86.51 %) y entre (13.49 %) poblaciones. Para los datos de distancias genéticas y geográficas se realizaron análisis de correlación y regresión lineal simple. La...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Holoparásita; Pholisma culiacanum; Diversidad genética; Cloroplasto; TrnL-F.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952016000700799
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La diversidad genética y la variabilidad genética: dos conceptos diferentes asociados al germoplasma y al mejoramiento genético vegetal JBAG
Rimieri,Pedro.
En este trabajo se diferencian a los recursos fitogenéticos in situ y ex situ para protección y conservación, de aquellos recursos que colecciona, mantiene y utiliza el hombre para su subsistencia desarrollando variedades cultivadas obtenidas por cualquier método de selección artificial. La imprecisión, confusión y distorsión encontradas en muchos trabajos relacionados al tema aquí planteado, con respecto a la terminología, su significado, sus alcances y sus consecuencias, motivaron el desarrollo de este trabajo de opinión. En mejoramiento, las colecciones de trabajo son utilizadas como una fuente de variabilidad y adaptación. En ese proceso de obtención de cultivares, indefectiblemente, se utiliza sólo una parte de la variabilidad genética del inicio, que...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Variabilidad genética; Diversidad genética; Fitomejoramiento; Recursos filogenéticos.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332017000300001
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Caracterización de la variabilidad genética en germoplasma de Melilotus albus mediante marcadores moleculares ISSR y SSR JBAG
Tomas,P.A; Rivero,M.N; Tomás,M.A.
Melilotus albus es una leguminosa naturalizada en Argentina con gran potencial como recurso forrajero para ser utilizado en ambientes marginales. El objetivo de este trabajo fue caracterizar 10 introducciones de la colección de INTA y de la FCA-UNL mediante marcadores moleculares. Cinco primers ISSR produjeron 52 bandas, 90 % de ellas fueron polimórficas, resultando todos los primers igualmente informativos. Los 8 loci SSR amplificados generaron 30 alelos, con un promedio de 3,8 alelos por locus, siendo altamente informativos la gran mayoría de ellos. En los análisis mediante técnicas numéricas la separación entre grupos no fue clara; los genotipos se congregan en grupos entremezclados. La mayor proporción de la variación se observó dentro de las...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Melilotus; Diversidad genética; Microsatélite; Forraje.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1852-62332017000100003
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